يعمل برنامج تربية الأحياء المائية للدراسات العليا على تطوير فهم مبادئ وممارسات تربية الأحياء المائية في مجموعة واسعة من المجالات. وتشمل هذه التغذية، ونوعية المياه، والتكاثر، وعلم الوراثة، وإدارة المفرخات، والبيئة، وعلم وظائف الأعضاء، وتربية الأسماك، والإنتاج، والإدارة الصحية، ومكافحة الأمراض، وجودة المنتج، وأنظمة تربية الأحياء المائية، وتكنولوجيا تربية الأحياء المائية، والتصميم التجريبي، وإحصاءات علم الأحياء، وبيولوجيا مصايد الأسماك، والإدارة، و الأعمال الحيوية.
تعتمد الدورات التدريبية على خبرات الشخصيات الرئيسية في الصناعة في جنوب أستراليا والذين يعملون في لجنة استشارية صناعية. وترتبط بهذه الدورات فرص العمل في مواقع سمك التونة، وسمك الكنعد الأصفر، والمحار، وأذن البحر، وبلح البحر، وجراد المياه العذبة. تشارك جامعة فلندرز في الأبحاث المشتركة مع الصناعات والموارد الأولية بجنوب أستراليا (PIRSA) ومعهد جنوب أستراليا للبحث والتطوير (SARDI).
يتضمن البرنامج تطبيقات عملية في المختبرات والأحياء المائية والخزانات ومتخصصي تربية الأحياء المائية واختيارًا مرنًا للموضوعات الاختيارية المتاحة من مختلف التخصصات.