يقدم قسم الهندسة الكيميائية والبيولوجية في كلية الهندسة برامج الدراسات العليا التي تؤدي إلى درجات الماجستير في العلوم التطبيقية (MASc)، والماجستير في الهندسة (MEng)، والدكتوراه في الفلسفة (PhD) في الهندسة الكيميائية.
الهدف الرئيسي لبرامج الماجستير هو تحسين المهارات والخبرات البحثية للطلاب من خلال توسيع معرفتهم المتخصصة في الهندسة الكيميائية والتي يتم تحقيقها بشكل أساسي من خلال الدورات الدراسية والندوات البحثية والتدريب الفني.
يتيح خيار الماجستير المسرّع لطلاب المرحلة الجامعية في الهندسة الكيميائية والبيولوجية في جامعة أوتاوا إمكانية المسار السريع للحصول على درجة الماجستير في العلوم التطبيقية (MASc) في جامعة أوتاوا. يتم تقديم هذا الخيار لتزويد الطلاب المتميزين والمتحمسين للبحث لبدء العمل للحصول على درجة الماجستير أثناء استكمال دراستهم الجامعية وبالتالي تسهيل إمكانية إكمال درجة الماجستير مبكرًا.
القسم هو إحدى الوحدات المشاركة في البرنامج التعاوني في العلوم والمجتمع والسياسة.