تؤكد الدراسات العليا في الهندسة البيئية في جامعة ولاية أوريغون على فهم المبادئ العلمية والهندسية الأساسية لإدارة وحل المشكلات البيئية في الأنظمة الطبيعية والهندسية. تم تصميم البرنامج التعليمي لتطوير قدرات تحليلية وتصميمية وإدارية قوية في تطبيق العمليات البيولوجية والكيميائية والفيزيائية. يتم إعداد الطلاب للمهن في مجال الاستشارات والتصميم، والرصد والإدارة البيئية، أو التدريس والبحث. تركز الأبحاث على المواد الخطرة، وعلم الأحياء الدقيقة البيئي، وأساسيات عمليات النقل في البيئة، والكيمياء البيئية، وموارد المياه الجوفية والمياه السطحية.
تقدم كلية الهندسة الكيميائية والبيولوجية والبيئية درجات ماجستير العلوم (MS)، وماجستير الهندسة (الدورات الدراسية فقط)، (MEng)، ودكتوراه في الفلسفة (Ph.D.) في الهندسة البيئية. تم تصميم البرنامج لتلبية احتياجات الطلاب الفردية والأهداف المهنية. إن تنوع اهتمامات أعضاء هيئة التدريس، والذي تم توسيعه وتعزيزه من خلال التعاون بين CBEE والأقسام الهندسية الأخرى ومراكز الأبحاث في الحرم الجامعي، يجعل البرامج الفردية المخصصة ممكنة.