يقدم قسم الهندسة النووية درجة الماجستير في العلوم حيث يمكن للطلاب اختيار برنامج يركز على الطاقة الانشطارية التقليدية، أو الأمن النووي، أو المواد النووية، أو يمكن للطالب اختيار تخصص الهندسة الإشعاعية.
يتطلب البرنامج إكمال 12 ساعة معتمدة للدراسات العليا من دورات الهندسة النووية و 12 ساعة معتمدة من دورات الدراسات العليا الإضافية. ويتطلب البرنامج خياراً بحثياً يختاره الطالب بالتنسيق مع لجنة الدراسات العليا للطالب ويعتمد على اهتمامات الطالب الشخصية وخلفيته الأكاديمية وخبرته العملية، فضلاً عن طبيعة المشاريع المتاحة حالياً في القسم. تتطلب الأطروحة من الطالب إجراء بحث مستقل ومتعمق. يشبه مشروع الممارسة الهندسية مشروع الأطروحة ولكنه أصغر في نطاقه ويمكن أن يكون بحثًا أو تصميمًا أو تطوير منتج أو عمليات خاصة أو مراجعة نقدية للأدبيات المنشورة في مجال تقني محدد. عادةً ما يتم إعداد التقرير النهائي لمشروع الممارسة الهندسية على شكل أطروحة؛ ومع ذلك، يمكن استخدام تنسيق تقرير رسمي آخر إذا وافقت عليه لجنة الدراسات العليا للطالب.