يقدم القسم تدريبًا للخريجين يؤدي إلى درجة الماجستير في علوم البستنة. كل إم إس. سيكون للطالب مستشار رئيسي يشرف على برنامج دراسته وأبحاث أطروحته. تتوفر التخصصات في عدة جوانب من علوم المحاصيل: البستنة العضوية والمستدامة، وإنتاج المحاصيل المتنوعة للنظم الغذائية الحضرية والإقليمية، والأثر البيئي للممارسات البستانية، والتنظيم البيئي لنمو النبات وتطويره، وتربية النباتات، والكيمياء الحيوية والبيولوجيا الجزيئية للنباتات البستانية، الزراعة الدقيقة والتكنولوجيا الحيوية، ومكافحة الحشائش وفسيولوجيا مبيدات الأعشاب، والإحصاء الحيوي. يتمتع الطلاب بفرصة تطوير مشاريعهم البحثية باستخدام الخضروات أو الفواكه أو الأشجار أو نباتات الزينة أو المحاصيل المتخصصة أو الأنواع النموذجية مثل Arabidopsis thaliana .
ذا إم.إس. سيتضمن مشروع أطروحة الطلاب استكشافًا موجهًا متعمقًا لسؤال بحثي وتطوير أطروحة مكتوبة بالتعاون مع لجنة الدراسات العليا المكونة من ثلاثة من أعضاء هيئة التدريس.
يضم القسم مختبرات الأبحاث وغرف البيئة الخاضعة للرقابة ومرافق الدفيئة. تتوفر مناطق قطع الأراضي مع مرافق التخزين والمختبرات المرتبطة بها في مشتل UWMadison، ومزرعة أبحاث البستنة في أرلينغتون، ومحطات البحوث الزراعية التي تديرها كلية العلوم الزراعية والحياة في مواقع مختارة في جميع أنحاء الولاية. وبالتزامن مع المزرعة الموجودة في Sturgeon Bay، تتم صيانة أكبر مجموعة في العالم من نباتات السولانوم المحملة بالدرنات من خلال المشروع الأقاليمي لإدخال البطاطس، وهي متاحة للاستخدام البحثي.