بالإضافة إلى درجة الماجستير الممنوحة ضمن برنامج الدكتوراه، يقدم NELC درجة ماجستير مستقلة (نهائية) في علم المصريات. يقدم برنامج الدراسات العليا في علم المصريات التابع لـ NELC دراسة متقدمة للغات وحضارات مصر القديمة.
يتم تعيين مستشار هيئة التدريس للطلاب المقبولين في برنامج الماجستير لتوجيه دراستهم. عادة ما يتم إكمال الدورات، التي يتم اختيارها بالتشاور مع المستشار، في ثلاثة فصول دراسية. يجب على جميع الطلاب، بغض النظر عن تركيزهم، إتقان لغة واحدة على الأقل من اللغات التي كتبت بها المصادر الأساسية للحقول الفرعية لـ NELC. تختلف المعايير حسب الحقل الفرعي.
